Mycklaflon är klassad som riksintressant med hänsyn dels till sjöns opåverkade status vad gäller näringshalt samt att Mycklaflon har Sveriges sydligste bestånd av storröding. Rödningens tillbakagång har medfört att åtgärder har satts in för att förbättra förhållandena åt rödningen. En skötselplan bör diskuteras fram med inriktning på att bevara en livskraftig population av storrödningen i Mycklaflon.