Calluna AB har, på uppdrag av Länsstyrelsen Jönköping, genomfört inventering av fladdermöss i Ängsö. Uppdraget ingår i den nationella biogeografiska uppföljningen av fladdermöss som syftar till att följa upp hur fladdermusfaunan utvecklas i några av Sveriges mest artrika områden. Callunas undersökning har utförts med två inventeringsbesök. Vid varje besök utfördes en manuell inventering och en autoboxinventering med sex autoboxar som spelade in fladdermössen i två nätter i sträck. Under inventeringen 2024 påträffades åtta arter, varav tre arter är rödlistade: brunlångöra, nordfladdermus och fransfladdermus. Totalt har 13 arter påträffats i Ängsö. Ett förslag är att flytta autoboxlokalerna 3 och 6 för att lokalisera nya miljöer med högre aktivitet, samt för att kunna lokalisera nya kolonier.