Försurningen utgör det största hotet mot vattenkvaliteten i länet.Ändå är bara mindre än 1% av länets sjöar så sura att försurningseffekter i form av skador på sjöns växt- och djurliv riskerar att uppstå. Hela 95% av sjöarna har istället en mycket god buffertkapacitet. Drygt 15 % av sjöarna är dock kalkade, vilket bidrar till det goda surhetstillståndet i länetssjöar.Sjöarnas innehåll av näringsämnen är övervägande lågt. ett näringsfattigt tillstånd är dock normalt för regionen eftersom jordarna i länet huvudsakligen består av näringsfattig morän.Metallhalterna i sjöarna är generellt mycket låga.