På uppdrag av Länsstyrelsen i Stockholms län har Ekologgruppen i Landskrona AB i maj 2012 undersökt bottenfaunan vid 14 lokaler i länet, varav två sjöar. Bedömning har gjorts av försurningspåverkan, föroreningspåverkan samt naturvärde. En bedömning av ekologisk status avseende surhet, näringspåverkan och ekologisk kvalitet har också gjorts.

Försurningspåverkan enligt försurningsindex NV 4913:

•  Obetydlig försurningspåverkan vid samtliga 14 lokaler

Organisk/eutrofierande föroreningspåverkan enligt NV 4913:

•  Betydlig påverkan vid en lokal
•  Måttlig påverkan vid fem lokaler
•  Svag påverkan vid fyra lokaler
•  Obetydlig påverkan vid fyra lokaler

Naturvärde:

•  Mycket högt naturvärde i Trönsjön och Skeboån-Harbroholmsån, Alhamra
•  Högt naturvärde i Bergshamraån och Norrtäljeån-Balkensån
•  Allmänt naturvärde på övriga 10 lokaler

Sammanvägd ekologisk status enligt NV 2007:4:

• Måttlig status i Märstaån
• God status hade Tyresån, Vitsån, Gråskaån och Åbyån
• Hög status hade övriga 9 lokaler