Staten äger fastigheten Gotland Eksta Stora Karlsö 1:5. Sjöfartsverket (SjöV) förvaltar det kombinerade Fyr & bostadshuset och Naturvårdsverket (NVV) förvaltar markområdet samt övriga fyra byggnader på fyrplatsen. Stora Karlsö fyrplats blev statligt byggnadsminne 1992 och omfattar samtliga fem byggnader samt mark och anläggningar inom fastigheten. Vårdprogrammet omfattar en kulturhistorisk värdebeskrivning, historik och nulägesbeskrivning samt mål och strategier för bevarande och utveckling. Programmet är också värdefullt som diskussions- och beslutsunderlag vid tillståndsprövning av ändringsförslag. I vardagen är det ett praktiskt styrdokument för alla som är verksamma med den dagliga förvaltningen av byggnadsminnet.På uppdrag av förvaltare Emma Wegrell, Sjöfartsverket, har vårdprogrammet utarbetats av arkitekt Daniel Heilborn, Länsstyrelsen på Gotland, Naturvårdsenheten. Från Naturvårdsverket har Hanna Lundkvist Handläggare, Fastighetsenheten medverkat. Riksantikvarieämbetet har deltagit vid samråd om vårdprogrammet.Inventering och dokumentation av Fyr & bostadshuset på St Karlsö har utförts under sommaren och hösten 2021. Vårdprogrammet färdigställdes under våren 2022.