System Aqua är ett nytt instrument för karakterisering av värdering av sjöar och/eller vattendrag (Naturvårdsverket, 1996). Vattendragsdelen i system Aqua testades, under 1996 och 1997, i den del av Nissans vattensystem som är beläget i Jönköpings län (Länsstyrelsen i Jönköpings län, 1997:40). Vid testet konstaterades att nästan alla indikatorer inom kriterierna Strukturell mångformighet och Naturlighet i objekten samt indikatorn fragmenteringsgrad i avrinningsområdet inte kunde bedömas enbart med hjälp av det underlag (bl.a. flygbilder) som System Aqua föreslagit.Länsstyrelsen i Jönköpings län har under de senaste åren utvecklat en metodik för biotopinventeringar av vattendrag (Länsstyrelsen i Jönköpings län, 1997:25). Metodiken har dessutom anpassats till System Aqua i de senare versionerna. Under arbetets gång har totalt 44 mil av vattendragen i Nissan inventerats. Det beslutades därför att ett kompletterande test av de ovan nämnda indikatorerna skulle utföras och baseras på biotopinventeringsmaterialet i Nissan.Målet med föreliggande rapport är således att komplettera testet av System Aqua (Länsstyrelsen i Jönköpings län, 1997:40) samt att utvärdera biotopinventeringsmaterialets lämplighet som underlag till System Aqua. Testerna har bekostats av Länsstyrelsen i Jönköpings län och Naturvårdsverket.