System Aqua är ett nytt bedömningsinstrument och har inte provats fullskaligt på ett helt vattendrag tidigare. Länsstyrelsen i Jönköpings län valde att tillämpa System Aquas vattendragsdel på Nissan. Bedömningen utfördes på de vattendrag i Nissans avrinningssystem som tillhör Jönköpings län. Under arbetets gång visade det sig att många av instruktionerna i System Aqua var alltför otydliga och flera frågeställningar dök upp. Detta medförde att arbetet förändrades från att använda System Aqua på Nissan till att testa tillämpningen av System Aqua. Studien har bekostats av Länsstyrelsen i Jönköpings län och Naturvårdsverket.