Under hösten 2003 har bottenfaunaundersökningar genomförts i åtta av länets rinnande vatten. Den huvudsakliga målsättningen var att utifrån bottenfaunan bedöma graden av försurningspåverkan och därmed ge underlag för den framtida kalkningsverksamheten i länet. Dessutom har påverkansgraden av näringsämnen/organiskt material, födounderlag för fisk samt bottenfaunans naturvärden bedömts vid de olika lokalerna.