Bottenfaunaundersökningar har utförts under hösten 1998 vid 50 lokaler inom 10 olika vattensystem i länet. Den huvudsakliga målsättningen var att bedöma försurningspåverkan och ge underlag för framtida kalkningsverksamhet. Av de 50 undersökta lokalerna ingår 45 i olika kalkningsprojekt.Proverna togs genom en standardiserad sparkmetod (SS-EN 27 828). Metodiken i Naturvårdsverkets miljövervakningshandbok följdes för övrigt.