Under det senaste århundradet har förekomsten av flodkräfta minskat dramatiskt i hela dess utbredningsområde. Den främsta orsaken till artens kraftiga tillbakagång anses vara kräftpest spridd genom utsättning av signalkräfta, ofta illegalt. Förekomst av signalkräfta innebär att kräftpesten blir permanent förekommande i det aktuella vattenområdet och återetablering av flodkräfta omöjliggörs för överskådlig framtid. Andra hot mot flodkräftan är försurning, utsläpp, föroreningar och vattenreglering. Länsstyrelsen i Örebro län genomförde år 2005 en enkätundersökning för att få en aktuell bild av kräftförekomsten i länet. Syftet med denna undersökning var att kartlägga aktuell förekomst av flodkräfta och signalkräfta samt undersöka hur utbredningen av dessa arter förändrats de senaste 10 åren. Undersökningen gav information om sammanlagt 211 vatten där 18 vatten uppgavs ha förekomst av flodkräfta, 117 förekomst av signalkräfta, 68 sakna kräftor samt åtta vatten med osäker förekomst av signalkräftor. Resultaten visar också att i 40 vatten som uppgavs ha förekomst av flodkräfta 1992/1996 har endast sju fortfarande flodkräfta, 20 vatten hyser signalkräfta och 13 vatten saknar kräftor. Rapporten ger förslag på åtgärder för att bevara flodkräftan i Örebro län