Fullständiga inventeringar av de fågelarter som häckar på Stora Karlsö har genomförts dels 1984-85 (Hedgren 1985), dels 1998 (Hedgren & Kolehmainen 2000). Mot bakgrund av de omfattande röjningarna under åren 2001-2004 (se fotografierna på sid. 9-10) bedömde Länsstyrelsen det vara angeläget att snarast genomföra en ny inventering för att se vad som hänt med fågellivet efter det att en betydande del av öns buskvegetation tagits bort. Länsstyrelsen gav därför Tuomo Kolehmainen i uppdrag att genomföra en återinventering enligt samma metodik som använts vid de tidigare inventeringarna. Fältarbetet utfördes huvudsakligen under tiden 1 maj-30 juni 2005. En del räkningar av alkfåglar genomfördes dock redan i april.