I föreliggande studie undersöktes mellanårsvariationer i vattenvegetations- och fiskyngelsamhällen i grunda havsvikar längs den svenska östersjökusten. Syftet med studien var att ta fram riktlinjer för uppföljningsintervaller inom miljöövervakning av dessa miljöer. Variationer i vegetations- och fisksamhällena undersöktes även med hänsyn till faktorer som beskriver vikarnas geografiska läge, form och öppenhet mot havet. Inventeringar av vegetation och fiskyngel utfördes från slutet av juli till september i Västerbottens, Gävleborgs, Uppsala, Stockholms, Östergötlands, Kalmar, Blekinge och Skåne län. I denna studie analyserades 50 vikar med avseende på vegetation och 41 vikar med avseende på fiskyngel.Resultaten visade att täckningsgraden av stora vattenväxter och trådformiga alger varierade mycket mellan åren. Artsammansättningen av vegetation var relativt likartad i vikarna mellan åren, men i vissa vikar, främst inneslutna, varierade artsammansättningen mycket. Det förekom ingen samstämmig mellanårsvariation i växtartsammansättning i de grunda vikarna, d.v.s. förekomsten av arter var inte likartat hög eller låg i flera vikar samma år. En betydandedel av skillnaderna i växtartsammansättning mellan vikarna kunde förklaras av skillnader i latitud och vikarnas öppenhet mot havet.Artsammansättningen av fiskyngel i vikarna varierade kraftigt mellan åren. Resultaten visade även en samstämmig mellanårsvariation av årsyngelsammansättningen, d.v.s. förekomsten av arter i vikarna var korrelerad till specifika år. Fiskyngelsammansättningen varierade även mycket med vikarnas öppenhet mot havet.Vi föreslår att inventeringsuppföljningar för naturtillståndsbedömning av grunda vikar görs med olika tidsintervaller för vegetation och fiskyngel samt för öppna och inneslutna vikar. Uppföljning av fiskyngelsamhället bör göras kontinuerligt och med korta tidsintervall, förslagsvis varje år, eftersom det är så stora mellanårsvariationer. Uppföljning av vegetationssamhället kan göras med längre tidsintervall i öppna vikar än i inneslutna vikar. Exempelvis kan vegetationen i öppna vikar inventeras enstaka år med påföljande tre till maximalt sex års intervall. För inneslutna vikar bör inventeringar ske vid tre på varandra följande år och därefter med exempelvis tre års intervall.