Store Mosse nationalpark inrättades 1982 i syfte att bevara Sydsveriges störstasammanhängande myrområde. Våtmarkskomplexets imponerande storlek ochrika växt- och djurliv med både nordliga och sydliga inslag utgjorde grundentill att nationalparken bildades.
Redan 1974 pekades Store Mosse ut som en internationellt värdefull våtmarkenligt Ramsarkonventionen. Store Mosse ingår även i Natura 2000-nätverketsedan 1995.Nationalparken är ett välbesökt område med ett väl utvecklat system avleder, flera fågeltorn och sedan början på 2000-talet även ett naturum vidhuvudentrén.
Även om syftet med Store Mosse nationalpark är det stora sammanhängandevåtmarksområdet så finns inom nationalparken även skogkläddafastmarksöaroch värdefulla kulturskapade naturmiljöer och naturbetesmarkerpå Lövö och Svänö. Våtmarkerna i sin tur har under mitten och slutetpå 1800-talet varit föremål för några diknings- och sjösänkningsprojekt föratt skapa mer jordbruksmark. Även torvbrytning har skett på ett par platseri nationalparken vilka delvis har återställts i ett större restaureringsprojekt.
Store Mosse är ett komplext område med höga naturvärden och upplevelsevärdenatt förvalta. Många avvägningar har gjorts för att hitta en balansmellan orördheten som en nationalpark förväntas representera och den skötselsom krävs för att bevara de höga naturvärden som nationalparken hyser.Förhoppningen är att denna skötselplan ska vara förvaltningens verktyg föratt lyckas med sitt uppdrag att förvalta ett av Sveriges finaste naturområden,en av Sveriges nationalparker.
Arbetet med att ta fram en ny skötselplan för Store Mosse nationalparkhar pågått mellan 2009 och 2015. Patrik Wandin, Länsstyrelsen i Jönköpingslän samt Gisela Norberg, Naturvårdsverket har ansvarat för skötselplanensframtagande.