I Stockholms län undersöktes vattenkvaliteten med hjälp av kiselalger på 15 vattendragslokaler och i två sjöar år 2020. För statusklassning med avseende på påverkan av näringsämnen och lättnedbrytbar organisk förorening användes kiselalgsindexet IPS. Stödparametrarna TDI (mängden näringskrävande arter) och %PT (andelen föroreningstoleranta arter) har beaktats vid bedömningen. För surhetsklassning användes ACID-index. Riskflaggning för att andra typer av påverkan, än de som IPS och ACID är utvecklade för att visa, gjordes med stödparametrarna missbildningsfrekvens, antal räknade taxa och diversitet.

IPS-indexet visade god status i Bergshamraån, Penningbyån och Norrtäljeån-Vretaån. Värdet för Bergshamraån och Penningbyån låg dock nära gränsen mot måttlig status. Även om IPS-indexet var högre i Norrtäljeån-Vretaån, kan även den lokalen sägas befinna sig i riskzonen för att hamna i måttlig status eftersom %PT visade betydande påverkan av organisk förorening.

Bedömningen måttlig status fick Fyrisån-Vidboån, Husbyån (Haninge), Muskån-Hammerstaån, Märstaån, Taxingeån, Tumbaån, Tyresån, Åvaån, Oxundaån, Åkerströmmen-Husaån, Saxbroån (Kagghamraån) samt sjöarna Norrviken och Orlången. Husbyån expertbedömdes från god till måttlig status. En riskflaggning utfärdades för Fyrisån-Vidboån, Taxingeån och Åvaån då missbildningsanalysen indikerade betydande påverkan av miljögifter.

I Bällstaån vid travbron motsvarade IPS-indexet otillfredsställande status. Stödparametern %PT visade mycket stark påverkan av organisk förorening. Dessutom riskflaggades lokalen för betydande miljögiftspåverkan.

På samtliga lokaler visade surhetsindexet ACID antingen alkaliska eller nära neutrala förhållanden.