Ecocom AB har på uppdrag av Länsstyrelsen Jönköping 2019 genomfört inventering av fladdermöss i Ängsö. Uppdraget ingår i den nationella biogeografiska uppföljningen av fladdermöss. 

Två inventeringsbesök genomfördes. Vid varje besök utfördes en manuell inventering och en autoboxinventering med 8 autoboxar som spelade in fladdermössen i två nätter i sträck. Under inventeringen 2019 påträffades totalt 11 st fladdermusarter, varav tre arter är rödlistade enligt den svenska rödlistan: dammfladdermus, fransfladdermus och sydpipistrell. Bland rödlistade eller särskilt skyddsvärda fladdermusarter är följande tidigare rapporterade från området: dammfladdermus, fransfladdermus och sydfladdermus. En av de 11 arter som tidigare påträffats kunde dock inte återfinnas vid inventeringen 2019: sydfladdermus. En förklaring kan vara att arten inte finns kvar i området. En annan förklaring kan vara att sydfladdermus finns kvar i området men inte uppehöll sig där vid tidpunkten för inventeringen. Sydpipistrell påträffades för första gången i Ängsöområdet 2019. Fyndet stämmer överens med artens kända utbredningsområde i Sverige. Totalt antal fladdermusarter som har påträffats i Ängsösområdet är 12 st arter. Ängsö är känd för att vara en artrik fladdermuslokal med hög täthet av kolonier (Ahlén & De Jong, muntligt). Ängsö framstår fortsatt som ett artrikt område för fladdermusfaunan norr om Mälaren.