Kunskapen om våra vattendrag håller sakta men säkert på att förbättras. Sedan år 2000 har över 100 av länets vattendrag biotopkarterats av länsstyrelsen eller andra aktörer. För många vattendrag är dock kunskaperna fortfarande mycket begränsade. Länsstyrelsen beslutade därför att ta fram en plan över vilka av länets vattendrag som ska biotopkarteras under den kommande femårsperioden. Biotopkartering är en metod för att inventera vattendrag som bl.a. innebär att man samlar in information om vandringshinder för fisk och antalet rensade och rätade sträckor i ett vattendrag. Denna information kan sedan användas som t.ex. underlag för olika biotopvårdande åtgärder eller för bedömningar av vattendragets ekologiska status inom arbetet med EU:s ramdirektiv för vatten. Planen omfattar totalt 85 vattendrag som i huvudsak valts ut antingen för att de hyser höga naturvärden eller för att de inom vattenförvaltningsarbetet bedömts ha måttlig eller sämre ekologisk status p.g.a. bristande kontinuitet. På längre sikt bör merparten av alla vattenförekomster biotopkarteras för att förbättra bedömningarna av hydromorfologi.