Elfiske är en standardiserad metod för att följa fiskbestånd i rinnande vatten. Under 1997 utförde Terra Limnogruppen elfisken på totalt 67 lokaler, i sammanlagt 41 vattendrag i huvudsak belägna i länets västra del, på uppdrag av Länsstyrelsen i Jönköpings län. Syftet med undersökningen är i första hand att följa fiskbeståndens utveckling efter kalkning och bedöma om de fortfarande är påverkade av försurningen eller ej. Tillsammans med övrig effektuppföljning som vattenprovtagning och bottenfaunaprovtagning utgör resultaten av elfiskeundersökningar ett viktigt underlag för utvärdering av kalkningsverksamheten. Vid elfiskeundersökningarna sensommaren 1997 dominerade öring (49 lokaler) och elritsa (35 lokaler)i fångsten. Övriga arter som påträffades var abborre, mört, bäckröding, gädda, bergsimpa, lake, nejonöga, ål, signalkräfta och flodkräfta. Endast två lokaler i Lagans vattensystem och en i Nissans vattensystem saknade både fisk och kräftor. Antalet arter i de kalkade vattendragen i Jönköpings län har ökat från i medeltal två till tre sedan början av 1990-talet. 1997:års öringtätheter är i samma storleksordning som tidigare noterats under 1990-talet. Även elfisken på okalkade sk. referenslokaler visar att 1997 års resultat inte nämnvärt avviker från tidigare år. Av de totalt 69 undersökta lokalerna bedömdes 19 lokaler ha en tämligen normal fiskfauna, medan 46 lokaler lokaler uppvisade störningar i varierande omfattning. Störningar i fiskfaunan kan bero på såväl försämrad vattenkvalitet, ex försurning, eller annan störning som vandringshinder eller förstörda biotoper.