Länsstyrelsen utför årligen egna vattenkemiska undersökningar och sammanställer även data från länets kommuner och recipientkontroll. Nedan presenteras kortfattat en sammanställning och klassning av näringstillståndet i Stockholms läns sjöar. Drygt hälften av sjöarna är näringsrika. Tillståndet i de östra delarna av Mälaren är avsevärt bättre än i sjöns övergödda västra delar.